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本帖最后由 漁歌子 于 2016-6-7 11:11 編輯
最新研究結(jié)果顯示:草魚(yú)是通過(guò)腸道微生物來(lái)利用所攝食的大量植物。
Metatranscriptomicdiscoveryofplantbiomass-degradingcapacityfromgrasscarpintestinalmicrobiomes
宏轉(zhuǎn)錄組學(xué)是在宏基因組學(xué)之后興起的一門(mén)新學(xué)科,能從轉(zhuǎn)錄水平研究復(fù)雜微生物群落變化,能更好地挖掘潛在的新基因。
盡管魚(yú)類(lèi)的經(jīng)濟(jì)價(jià)值很重要,但是魚(yú)類(lèi)腸道微生物組的生態(tài)學(xué)和代謝能力在很大程度上還是未知的。草魚(yú)(Ctenopharyngodonidellus)是一種草食性淡水魚(yú)類(lèi),我們采用宏轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的方法測(cè)定了草魚(yú)腸道微生物的類(lèi)群。實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,草魚(yú)腸道主要微生物類(lèi)群為厚壁菌門(mén)、梭菌門(mén)、變形菌門(mén)和擬桿菌門(mén)。比較不同食物草魚(yú)腸道微生物轉(zhuǎn)錄組,我們發(fā)現(xiàn)宿主的食物會(huì)影響腸道微生物的代謝。通過(guò)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析我們發(fā)現(xiàn)草魚(yú)腸道存在參與纖維素、木聚糖、甘露聚糖和果膠主鏈降解的水解酶,此外,在草魚(yú)腸道發(fā)現(xiàn)有大量的可降解非纖維素多糖的葡萄糖水解酶。草魚(yú)腸道微生物主要的COG類(lèi)群與能量的產(chǎn)生、轉(zhuǎn)換以及碳水化合物和氨基酸的轉(zhuǎn)運(yùn)、代謝有關(guān)。以上結(jié)果說(shuō)明草魚(yú)腸道微生物可以通過(guò)對(duì)碳水化合物的分解、發(fā)酵為自身和宿主提供能量。草魚(yú)腸道微生物反映了宿主在能量獲得方面的適應(yīng)進(jìn)化能力,即草魚(yú)通過(guò)大量攝食植物性食物,通過(guò)對(duì)植物細(xì)胞內(nèi)多糖的利用,而不是通過(guò)對(duì)纖維素的降解,獲得能量。(轉(zhuǎn)處中國(guó)水產(chǎn)論壇/fishdis)
Metatranscriptomic discovery of plant biomass-degrading capacity.rar
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2016-6-7 11:11 上傳
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